Pour cette première saison, souvent jugée comme la meilleure de la série, le décor est planté et les caractères des personnages progressivement établi : Malcolm, le surdoué incompris, Reese, l'imbécile heureux, Dewey, le cadet malicieux et manipulateur, Lois, la mère tyrannique, Hal, le père totalement irresponsable, sans oublier Francis, le frère aîné envoyé en Alabama dans une école militaire dirigée par le Commandant Edwin Spangler, dans laquelle il défie une nouvelle fois l'autorité. La saison 1 marque les esprits par des intrigues inventives et des situations rapidement devenues cultes !